Big Data, tekoäly, sote, tietosuoja-asetus… BMF:n kevätseminaari 2018

(Please, scroll down to read a short summary in English.)

Tietoasiantuntijan täytyy pysyä ajan tasalla monenlaisista asioista. Lääketieteen ja lähialojen suomalaisten kirjasto- ja tietopalveluammattilaisten yhdistyksen Bibliothecarii Medicinae Fenniae (BMF) ry.:n tämänvuotinen kevätseminaari kokosi yhteen esityksiä monesta ajankohtaisesta aiheesta, jotka vaikuttavat eri alojen tietoasiantuntijoiden ja erityisesti terveystieteiden tietoasiantuntijoiden työhön.

Pääpuhujana oli dosentti Ilkka Kunnamo (Duodecim Oy) aiheenaan tyhjentävästi Big Data. Hän aloitti “big data” -käsitteen kuvailun neljän V:n avulla, jotka viittaavat datan määrään (volume), datan moninaisuuteen (variety), datan syntyvauhtiin (velocity) ja datan totuudenmukaisuuteen (veracity). Mieleenpainuvaa oli, miten datan määrä kasvaa tällä hetkellä kiihtyvästi. Hyvinä esimerkkeinä hän mainitsi esimerkiksi, että vuonna 2012 vuosittain ilmestyvien uusien lääketieteellisten artikkeleiden määrä ylitti yhden miljoonan rajan, tai että yksi genomisekvensoija tuottaa viidessä kuukaudessa noin 650 teratavua dataa. Siinä on haastetta niin tutkijoille kuin tietoasiantuntijoillekin! Kunnamo esitteli myös visioita siitä, miten tulevaisuudessa meistä kerättyä moninaista datamäärää, kuten vaikkapa genomiikka- tai metabolomiikkatason tietoa, voitaisiin hyödyntää tehokkaammin terveydenhuollossa esimerkiksi mietittäessä lääkityksen aloittamisen hyötyjä potilaalle suhteessa siitä mahdollisesti potilaalle aiheutuviin sivuvaikutuksiin ja hänen kokemaansa elämänlaatuun. Kunnamo toi kuitenkin hyvin esille esityksensä lopussa, että vaikka tekoälystä saattaa olla apua esimerkiksi joidenkin sairauksien ennustemallien tuottamisessa, se ei korvaa laadukkaita satunnaistettuja kontrolloituja tutkimuksia (RCT). Kuten ihmistenkin tuottamaan dataan myös tekoälyn tuottamaan tietoon tulee suhtautua tieteellisen tutkimuksen edellyttämällä kriittisyydellä.

Ilkka Kunnamo puhui Big datasta.

Toinen kutsuttuja puhuja, johtava tietoasiantuntija (Helsingin yliopisto, Terkko Health Hub, kirjasto) Jukka Englund kertoi Iris.AI:sta, joka on tekoälypohjainen tiedonhaun assistentti. Yksinkertaistettuna esittelet tiedonhaun aiheesi ja tutkimuskysymyksesi  Iris.AI:lle lyhyellä englanninkielisellä  abstraktilla, jonka jälkeen Iris.AI tekee erilaisia “viitekarttoja” aiheestasi. Kun annat palautetta Iris.AI:lle sen tekemän haun hyvistä puolista ja kerrot, mikä meni huonommin, Iris.AI oppii aiheestasi enemmän ja pystyy tekemään sinulle osuvamman haun. Aivan automaattiseksi tiedonhaku ei kuitenkaan ole muuttumassa, sillä ihmistä tarvitaan aina antamaan palautetta ja opettamaan konetta; tekoäly ei päihitä ihmisälyä! Muun muassa Itä-Suomen kirjastopäivillä on tarjolla lisätietoa tästä aiheesta.

Jukka Englund kertoi Iris.AI:sta.

Kolmannen pidemmän esityksen aihe oli huippuajankohtainen EU:n tietosuoja-asetus, josta puhui kehittämispäällikkö Ulla Ahlblad-Bordi Terveyden ja hyvinvoinnin laitokselta (THL). Uuden EU:n tietosuoja-asetuksen (General Data Protection Regulation, GDPR) päätavoitteina on vahvistaa yksilön henkilötietojen suojaa ja yksilön oikeuksia mutta myös edistää tietojen liikkumista jäsenvaltioiden välillä.  Yksilön henkilötietojen suoja ei suinkaan ole uusi asia, mutta uusi EU tietosuoja-asetus ja uusi kansallinen tietosuojalaki tuovat joitakin uusia periaatteita mm. henkilötietojen käsittelyyn. Esimerkiksi tutkimustiedon kerääminen, tiedon käyttö ja sen tuhoaminen tai arkistointi on suunniteltava entistä tarkemmin, ja tietosuojaan liittyvät riskit on otettava huomioon jo tutkimuksen suunnitteluvaiheessa. Yhä enemmän painotetaan sitä, että tutkittavilta tulee kerätä vain ne henkilötiedot, jotka ovat tarpeen tutkimuksen tekemisen kannalta. Tutkittavalla saattaa olla oikeus tarkastaa hänestä kerätty tieto, ja etukäteen on mietittävä, miten tämä käytännössä toteutetaan. Uutena periaatteena on ns. tutkijan osoitusvelvollisuus eli on pystyttävä osoittamaan, että tietosuoja-asetuksen periaatteita on noudatettu.  Myös oikeus tulla unohdetuksi, jatkuva päivitysvelvollisuus ja mahdollisuus siirtää tiedot järjestelmästä toiseen ovat uusia määräyksiä. EU-tason tietosuoja-asetusta täydennetään ja täsmennetään kansallisella lainsäädännöllä, jonka on tarkoitus tulla voimaan samaan aikaan eli 25.5.2018, kun tietosuoja-asetusta aletaan soveltaa kaikissa jäsenmaissa.

Tuulevi Ovaska piti esityksen sote-uudistusta sivuavasta aiheesta.

Lyhyitä, 10-15 minuutin puheenvuoroja oli ohjelmassa jäsenistölle tehdyn kutsun pohjalta saatu mukaan neljä, joista kaksi UEFin kirjastosta. Erikoissuunnittelija Mari Mäkinen (THL) kertoi palvelujen kokeilevasta kehittämisestä otsikolla Tietoaineistot tehokäyttöön ja informaatikko Arja Kunnela (Jyväskylän ammattikorkeakoulu) otsikon JAMK – local global library in Finland! alla muun muassa monimuoto-opiskelun ja etätyön sekä koulutusmyynnin ja kansainvälisten hankkeiden kirjaston palveluille asettamista haasteista.

Tuulevin lyhyt esitys Uutishuoneesta, hyvää päivää! kertoi kirjaston viestinnän uudelleen organisoitumisen tarinan, joka on pian luettavissa kirjaston vuosikertomuksesta. Toisen esityksen — Sote-uudistusta odotellessa — aiheesta on julkaistu artikkeli Arja Halkoaho, Kirsi Luoto, Tuulevi Ovaska, Jarmo Saarti, Tuomas Selander: Supporting the medical research and daily work at the hospital – analysing the library and information services at the Kuopio University Hospital.  Journal of the European Association for Health Information and Libraries 2018;14:9-14, ja puheenvuoro Kirsi Luoto, Tuulevi Ovaska, Jarmo Saarti: Yliopistosairaaloiden kirjasto- ja tietopalveluita ei tule unohtaa sote-uudistuksessa. Sosiaalilääketieteellinen aikakauslehti 2018;55:172–174.

BMF:n seminaarit ovat ajankohtaisen tietoannin lisäksi aina myös erinomaisia verkostoitumistilanteita ja -tapaamisia, joissa sekä kohtaa uudelleen että tutustuu uusiin alan kollegoihin koko maasta.

Esitysten materiaalit ovat saatavilla BMF:n sivuilla.

Briefly in English: Bibliothecarii Medicinae Fenniae (BMF) is a professional association for medical and health librarians and information professionals in Finland. BMF’s spring seminar 2018 included presentations about Big Data, Articificial Intelligence in information retrieval, EU’s General Data Protection Regulation (GDPR), service development, libraries as both local and global services, library communications reorganisation and university hospital library services in the context of the health and social services reform.

Virpi Lindi, tietoasiantuntija | information specialist
Tuulevi Ovaska, erityistietoasiantuntija | information specialist & communications coordinator
Opetus- ja tietopalvelut | Training and information services

Kuvakollaasit | Photo collages: Katri Larmo | BMF

Jaa tämä / Share this
Share

Tarvitsetko kansainvälisiä tutkimuksia? Kirjaston monipuolisia, eri tieteenalojen tietokantojen koulutuksia verkossa. Tervetuloa! | Library trainings

(Please, scroll down to read briefly in English.)

Kirjaston maksuttomat koulutukset suomeksi eri tieteenalojen tietokannoista UEFin opiskelijoille, henkilökunnalle ja kaikille kiinnostuneille alkoivat tammikuussa ja jatkuvat huhtikuulle saakka.

Kevään 2018 koulutuksia:

  • 30.1.2018 Kansallisen Finnan peruskäyttö.  Katso tallenne YouTubessa
  • 13.2. 2018 klo 9-10 PubMed/MEDLINE-tietokanta
  • 6.3.2018 klo 9-10 SocINDEX (Ebsco) & Social Science Premium Collection (ProQuest)
  • 22.3. 2018 klo 9-10 Scopus & Web of Science
  • 17.4.2018 klo 9-10 CAB & MathScinet-tietokannat

Ilmoittautuminen UEF-henkilökunnalle HRM-kalenterin kautta ja muille e-lomakkeella. Koulutukset ovat verkossa Skype for business -yhteydellä. Tiedotamme koulutuksista lähempänä. Nauhoitamme koulutukset ja tallenteet löytyvät koulutuksen jälkeen YouTubesta UEFLibrary-kanavalta.

Jatkamme tietokantakoulutuksia myös ensi syksynä. Voit esitää meille toiveita: tietopalvelu[at]uef.fi!

Kirjaston koulutustarjottimelta löydät myös muita ajankohtaisia koulutuksiamme. Kutsu tietoasiantuntija maksutta laitoksellesi kouluttamaan kokoamaasi ryhmää tai tutkimusryhmäsi tapaamiseen tai laitoskokoukseen. Koulutukset on mahdollista järjestää myös Skype for Business –yhteydellä. Voimme myös räätälöidä koulutuksen tarpeidenne mukaan.

Valitse koulutustarjottimen tarjonnasta sopiva kokonaisuus ja ota yhteyttä: tietopalvelu[at]uef.fi.

Tervetuloa!

Briefly in English

Check out our topical training possibilities and update your expertise by utilising our versatile training menu. Invite us to a research group meeting or a department conference. Training sessions can be organised also via a Skype for Business connection. We can tailor the training according to your needs. It is free of charge — just pick a suitable training package from the menu and contact us: information.services[at]uef.fi.

Kaisa Hartikainen, tietoasiantuntija | information specialist
Tuula Rissanen, tietoasiantuntija | information specialist
Opetus- ja tietopalvelut | Training and information services

 

Jaa tämä / Share this
Share

Mitä saa kun hakee UEF-Finnan kansainvälisistä e-aineistoista? | What can you find when searching through the international e-materials in UEF Finna?

(Please, scroll down to read in English.)

UEF-Finnassa voi valita haetaanko aineistoa kirjaston kokoelmista, Varastokirjastosta, Arto-tietokannasta tai kansainvälisistä e-aineistoista. Perushaun kirjaston kokoelmista voi tehdä heti ensimmäisellä hakusivulla jolloin haun tuloksen näkee Kirjaston kokoelmat -välilehdellä. Saman haun voi näppärästi toistaa klikkaamalla ensimmäisellä hakutulos-näytöllä Kansainväliset e-aineistot -välilehteä, jolloin pääsee suoraan katsomaan viitteitä, jotka tulevat Primo Central Indexistä (PCI). Koska kyseessä ovat kansainväliset aineistot, kannattaa yleensä hakea esimerkiksi englanniksi.

Kansainvälisistä e-aineistoista haun voi valita UEF-Finnan etusivulla myös suoraan, ja jos valitsee tarkennetun haun, voi haun kohdistaa esimerkiksi otsikkoon.

Minkälaisia viitteitä e-aineistohaulla saa?

Kansainvälisistä e-aineistoista haettaessa tuloslistalle tulee viitteitä esimerkiksi lehtiartikkeleista ja e-kirjoista useilta eri tieteenaloilta ja eri kustantajilta. Hakutulos on yleensä laaja ja sitä voi supistaa listan oikeassa reunassa näkyvillä vaihtoehdoilla muun muassa aiheen, aineistotyypin, tekijän, kielen ja lähteen mukaan.

Lähde onkin ”avain” siihen, mistä aineistoista hakutulokset ovat tulleet. Toisin kuin perinteisesti tiedonhaussa on aiemmin tehty eli ensin on valittu tarkkaan vaikkapa oman alan tietokanta, jossa hakua on lähdetty tekemään ja mahdollisesti jo heti alussa on asetettu haulle rajauksia esim. vuoden suhteen, PCI-haussa haku tehdään ensin suuresta joukosta tietokantoja ja kustantajien palveluita, jonka jälkeen hakutulosta sitten rajaamalla pienennetään.

Lähde kertoo, mistä aineistosta kulloisenkin haun viitteet ovat tulleet. Primo Central Index (PCI), johon kansainvälisten e-aineistojen haku siis kohdistuu, on erittäin suuri tietokanta, johon on indeksoitu valmiiksi haun nopeuttamiseksi useiden kustantajien viitetietoja. Kirjasto on aktivoinut palveluun sekä kirjaston hankkimia viitetietokantoja että ilmaisia aineistoja. Tuttuja tietokantoja tai kustantajia, joiden palveluita palveluun on aktivoitu ovat esim. Scopus, PubMed, Proquest, DOAJ, PsycArticles, Cambridge, Elsevier, Nature, Springer, Wiley, Sage, Web of Science, Lippincott Williams & Wilkins ja Oxford.

Tiedonhaun jälkeen e-aineiston kokotekstiin, esim. yksittäiseen lehtiartikkeliin pääsyn voi tarkistaa Verkossa saatavilla -linkeistä. PCI tarjoaa viitteitä aineistoihin, SFX-linkityspalvelu puolestaan ohjaa niihin aineistoihin, joihin on pääsy. Kannattaa siis huomioida, ettei läheskään kaikkien viitteiden kokoteksteihin ole pääsyä, ja että etäyhteydellä haettaessa on muistettava kirjautua UEF-Finnaan UEFin tunnuksilla tai etäyhteyden kautta.

Kansainvälisellä e-aineistohaulla haetaan siten erittäin laajasta joukosta aineistoja kerralla. Kirjaston lisensoimat yksittäiset tietokannat löytyvät UEF-Finnasta kirjaston kokoelmista. Niitä voi hakea tietokannan nimellä tai selailemalla aiheittain. Varsinainen tiedonhaku tehdään sitten tietokannan omassa käyttöliittymässä, johon UEF-Finnassa on linkki. Laajan yleissilmäyksen kiinnostuksen kohteeseen saa siten hakemalla Kansainvälisistä e-aineistoista ja tarkemman haun saa tehtyä alanmukaisessa tietokannassa.

 

In the UEF Finna, you can choose between searching the collections of the UEF Library, the National Repository Library, Arto database or international e-materials. A basic search focused on the UEF library’s collections can be performed via the home page, and the results will show up on the Library’s collections tab. You can repeat the same search just by clicking the International e-materials tab, which directly allows you to see references from Primo Central Index (PCI). Because the searches focus on international materials, it would be good to perform the searches in English.

You can also choose the International e-materials search straight away on the UEF Finna home page, and if you choose the Advanced search, you can target the search to, for instance, titles of articles.

What kind of references can you find using the e-materials search?

When searching from the international e-materials, references about journal articles and e-books of different fields of science and different publishers may show up in the results. The search results are usually extensive and can be narrowed down using the options on the right-hand side of the page by subject, format, author, language and source, for example.

The source is a “key” to see which materials the search results originate from. Unlike in traditional information retrieval where you first carefully choose a specific database of your own discipline and possibly restrict the search within a certain time limit, in PCI searching you first perform a broad search on a great number of databases and publisher services, after which you narrow down the results. The source indicates from which database the references of each search have been retrieved.

PCI, which is the focus of international e-materials searches, is an immensely vast database. Reference information from several publishers is indexed within it in order to speed up the searches. The UEF Library has activated purchased reference databases and free materials in the service. Services of popular databases or publishers that have been activated in the service include Scopus, PubMed, Proquest, DOAJ, PsycArticles, Cambridge, Elsevier, Nature, Springer, Wiley, Sage, Web of Science, Lippincott Williams & Wilkins and Oxford.

After the search, you can check the availability of full text e-material by using the Available online links. PCI provides references to materials, while SFX linking services directs you to the available materials. It is worth noting that not even nearly all the full text materials referred to in the results can be accessed, and that while searching outside the campus network, you are required to login to the UEF Finna using you UEF username and password or to use remote access.

Thus, the international e-materials search is used to get results from a great number of materials at one time. The separate databases licensed by the UEF Library can be found in the Library’s collections in UEF Finna. They can be searched by database title or by browsing each subject. The actual information retrieval is then performed in the databases own interface, which you are directed to via UEF Finna. You can get a broad general view to an interest by searching from the International e-materials, and a more precise search can be performed within a discipline-specific database.

Anu Eskelinen
Tietoasiantuntija | Information Speclialist
Verkko- ja julkaisupalvelut | Library IT and publishing services

Jaa tämä / Share this
Share

Upottaako tiedon suo? Hae tietoasiantuntijalta pitkospuut!

Meitä on naisia ja miehiä, tummia ja vaaleita, pidempiä ja lyhempiä, pohdiskelevampia ja räiskyvämpiä, yhteensä 10 henkeä, kirjasto- ja tietopalvelualan työkokemusta kaikkiaan yli 200 vuotta!

Kaikilla oppiaineilla on oma tietoasiantuntija. Jokainen meistä on valmis auttamaan sinua löytämään opiskeluissasi tarvitsemasi tiedonlähteet. Ota yhteyttä meihin, kun olet solmussa tiedonhaun kanssa tai muuten kaipaat apua lähteiden löytämiseen.

Yhteystiedot ja eri tieteenalojen tärkeimmät tietokannat/tiedonhaun apuneuvot

Jos kaipaat tiedonhakuun henkilökohtaista ohjausta tai opastusta, varaa aika.

Voit lähettää viestin myös yhteiseen sähköpostiimme: tietopalvelu[at]ef.fi

Tiedäthän, että oman alasi tiedonhaun verkkokurssin suorittamisesta voi olla hyötyä juuri nyt? Kurssilla opit oman alasi tärkeimmät tieteelliset tiedonlähteet ja järjestelmällisen tiedonhaun perusteet. Hae Oodista esim. sanalla “tiedonhaku”.

Tältä me näytämme:

laura_ja_merja_blogi

Merja Kauppinen, biologia, kemia, psykologia ja kauppatieteet & Laura Parikka, metsätieteet, fysiikka, maantiede ja yhteiskuntatieteet, työhuoneet Joensuussa. Kuva: Riitta Holopainen

jussi_ja_riitta_blogi

Jussi Hyvärinen, teologia, yleinen kielitiede, kirjallisuus sekä saksan ja suomen kielet & Riitta Holopainen, kulttuuritieteet sekä englannin, ruotsin ja venäjän kielet, työhuoneet Joensuussa. Kuva: Laura Parikka

Tapani_ja_MarjaMarja Aho, kasvatustieteet & Tapani Toivanen, historia, oikeustiede ja tietojenkäsittelytiede; työhuoneet Joensuussa. Keskellä Larin Paraske. Kuva: Jussi Hyvärinen

tomi

Tomi Rosti, matematiikka, työhuone Joensuussa. Kuva: Laura Parikka

Maarit Putous, Heikki Laitinen ja Tuula Rissanen Heikki Laitinen, luonnontieteet, farmasia ja ravitsemustiede & Maarit Putous, kauppatieteet, sosiaali- ja terveysjohtaminen, hoitotiede & Tuula Rissanen, sosiaalityö ja sosiaalitieteet, työhuoneet Kuopiossa. Kuva: Henna Ruuskanen

kaksi tietoasiantuntijaaTuulevi Ovaska & Kirsi Salmi, ergonomia, hammaslääketiede, kansanterveystiede, liikuntalääketiede ja lääketiede sekä Kuopion yliopistollinen sairaala, työhuoneet Kuopiossa. Kuva: Mia Haapanen

Ota yhteyttä!

Jaa tämä / Share this
Share

PubMedissa on nyt yli 25 miljoonaa viitettä – Miten löydät niiden joukosta ne joita tarvitset? / PubMed now has more than 25 million citations – How to find among them the ones you need?

PubMed-tietokantaan tallennettiin 16.6.2015 kahdeskymmenesviidesmiljoonas viite. Haku yhdellä tai kahdella hakusanalla tuottaa valtavasta tietokannasta niin suuren määrän viitteitä, että täsmälliseen tiedontarpeeseen sopivan löytäminen vie paljon aikaa. Miten hakutulosta saisi toisaalta osuvammaksi mutta myös kattavammaksi?

Näillä keinoilla

  • Haun suunnittelu
    • Aihetta kuvaavat käsitteet ja niitä vastaavat hakusanat
  • Boolen logiikka
    • Videossa ei haeta PubMedistä, mutta sama logiikka toimii kaikissa tietokannoissa
    • Hakulauseella “pulmonary tuberculosis” AND (treatment OR therapy) saa täsmällisemmän tuloksen kuin haulla tuberculosis treatment
  • MeSH-termit
    • Videossa haetaan influenssarokotteiden mahdollisia haittavaikutuksia kananmuna-allergikoille
    • edellisestä aiheesta hakulause MeSH-termein voisi olla “Tuberculosis, Pulmonary/therapy”[Mesh]
  • Rajaukset
    • PubMedin vasemman reunan rajausmahdollisuuksista osa on piilossa (klikkaa more) ja muutenkin rajausten tekeminen on monivaiheista
    • Kannattaa silti käyttää tilanteen mukaan esimerkiksi julkaisutyyppi-, julkaisuaika-, julkaisukieli- ja ikäryhmärajauksia
    • Video
    • Vältä rajausta Free full text. Se jättää hakutuloksesta pois kirjaston hankkimat ja maksamat lehdet.

 

On June 16, 2015, the 25 millionth journal citation was added to PubMed. Searching with one or two words retrieves such a huge amount of citations that it takes a long time to find the ones that answer your question. How to make the search result more accurate but also more comprehensive?

With these tools

  • Planning the search
    • The concepts that describe the topic and the terms for them
  • Boolean logic
    • Same logic of combing search terms in all databases
    • Using “pulmonary tuberculosis” AND (treatment OR therapy) gives a more accurate set of results than tuberculosis treatment
  • MeSH terms
    • Video shows how to search if there are concerns with flu vaccines and egg allergy
    • About the topic above the search using MeSH could be “Tuberculosis, Pulmonary/therapy”[Mesh]
  • Limits
    • Some of the Limit options in PubMed are hidden (click more to see them) and using the limits is sometimes complicated
    • Try anyway, depending on your topic, for example article types, publication dates, languages, and ages
    • Video
    • Avoid using the limit Free full text. It omits the journals the library has subscribed and paid for.

 

Tuulevi Ovaska
palvelupäällikkö, tietoasiantuntija
head of services, information specialist

Jaa tämä / Share this
Share