Tag: PubMed

Posted on

PubMedin NCBI-tilin kirjautuminen muuttuu | PubMed NCBI account login will change

(See Important Changes to NCBI Accounts Coming in 2021 for information and instructions in English.)

Käytätkö MyNCBI-tiliä, jonne voit tallentaa hakuja uutuusseurantaa varten sekä hakujen tuloksia?

Yhdistä NCBI-tilisi toiseen kirjautumistapaan (UEF, ORCID, Haka-luottamusverkoston jäsen) ennen 1.6.2021, koska sen jälkeen NCBI-kirjautuminen ei enää toimi.

Yhdistetty kirjautuminen otetaan käyttöön näin:

  1. Kirjaudu PubMedissä kuten ennenkin.
  2. Klikkaa käyttäjänimeäsi (username) ja sitten Account settings.
  3. Klikkaa Change kohdassa Linked Accounts.
  4. Voit valita yhdistettäväksi tiliksi  jonkin tai useamman valikossa University/institutional listatuista. UEF löytyy esim. hakusanoilla eastern finland. Muita suomalaisia organisaatioita saat listattua hakemalla finland. Voit käyttää myös ORCiD-tunnustasi. (Lisätietoja ORCiD-tutkijatunnisteesta.)
    • A) Valittuasi yhdistettäväksi tiliksi UEFin päädyt sivulle, jolla lukee You are trying to log in to: NIH SP. Kirjaudu UEFin tunnuksillasi, tarkista tiedot ja hyväksy yhdistäminen.
    • B) Valittuasi yhdistettäväksi tiliksi ORCIDin päädyt sivulle, jolla lukee National Center for Biotechnology Information has asked for the following access to your ORCID record: Read your information with visibility set to Trusted Parties. Klikkaa Authorize access.
  6. Palaat automaattisesti takaisin Linked Accounts -sivulle, jolla lukee nyt New account successfully linked.

Voit käyttää MyNCBI-palveluja kutenkin ennenkin. Uutuusvahtisi ja viitteesi pysyvät tallessa. Toimi viimeistään toukokuussa, ettet menetä tallentamaasi tietoa.

Kuvakaappaus NCBI-tilin asetuksista, | Screen shot of NCBI Account Settings.

Lisätietoa uutuusvahdeista, myös PubMedin NCBI:sta, Pysy ajan tasalla! -blogikirjoituksessa.

Tuulevi Ovaska, erityistietoasiantuntija | Senior Information Specialist
Opetus- ja tietopalvelut | Training and Information Services

 

Posted on

Uusi PubMed | New PubMed

PubMed-haut tehdään toukokuun puolivälin jälkeen uudella PubMed-sivustolla. Vanha (legacy) PubMed lopetetaan pian kokonaan. Siirry käyttämään uutta PubMedia.

The new PubMed site will become the default in mid-May. More information in English: New PubMed Transition FAQs

Uutta PubMediä kehitetään jatkuvasti, aivan kuten edellistäkin. Vanha PubMed toimii uuden kanssa rinnakkain lyhyen ajan, kenties kesään saakka tai kesän yli. Aikataulu tarkentunee toukokuussa.

Yksi näkyvimmistä parannuksista on uuden sivuston responsiivisuus. PubMedia voi käyttää mobiililaitteella, tietokoneella ja tabletilla samoilla ominaisuuksilla ja toiminnoilla. Aikaisemmin oli saatavilla vain hyvin yksinkertainen mobiiliversio. Vanhaan PubMediin muualta tehdyt linkitykset ohjautuvat automaattisesti uuteen PubMediin, ja nämä uudelleenohjaukset ovat pysyviä. Mahdollinen oma MyNCBI -tilisi ja sinne tallennetut kokoelmat, haut ja uutuusvahdit toimivat edelleen.

Jos teet saman haun nyt sekä uudessa että vanhassa PubMedissa, voit huomata eron hakutulosten määrässä. Se johtuu monista asioista. Ensinnäkin tietueita lisätään eri versioihin eri aikoina, samoin poistetaan tuplatietueita. Lisäksi automaattista hakusanojen tulkintaa ja yhteenliittämistä – kuten britti- ja amerikanenglannin erilaisen oikeinkirjoituksen ohittamista, yksiköiden ja monikoiden yhdistämistä, synonyymien automaattista hakemista – on muutettu kattavammaksi.

Ison muutoksen hakutuloksen määrään voi aiheuttaa hakusanojen katkaiseminen katkaisumerkillä (*), koska katkaistuina haettavien sanojen määrässä ei ole enää rajoitusta. Katkaistussa hakusanassa on kuitenkin oltava vähintään neljä ensimmäistä merkkiä. Jos haluat hakea täsmällisellä termillä (sanalla tai fraasilla), käytä sen ympärillä lainausmerkkejä, jolloin haetaan vain kyseistä merkkijonoa, ilman tulkintoja. Myös fraasin eli moniosaisen hakutermin voi nyt katkaista, mutta vain fraasin viimeisen sanan.

Näet hakuhistoriasta kohdasta Details, miten PubMed hakusi tulkitsee. | Click Details in Search History to see how your search is interpreted.

Tarkempia ohjeita videotallenteina:

Tuulevi Ovaska, erityistietoasiantuntija | information specialist
Opetus- ja tietopalvelut | Training and Information Services

Posted on

PubMedissa on nyt yli 25 miljoonaa viitettä – Miten löydät niiden joukosta ne joita tarvitset? / PubMed now has more than 25 million citations – How to find among them the ones you need?

PubMed-tietokantaan tallennettiin 16.6.2015 kahdeskymmenesviidesmiljoonas viite. Haku yhdellä tai kahdella hakusanalla tuottaa valtavasta tietokannasta niin suuren määrän viitteitä, että täsmälliseen tiedontarpeeseen sopivan löytäminen vie paljon aikaa. Miten hakutulosta saisi toisaalta osuvammaksi mutta myös kattavammaksi?

Näillä keinoilla

  • Haun suunnittelu
    • Aihetta kuvaavat käsitteet ja niitä vastaavat hakusanat
  • Boolen logiikka
    • Videossa ei haeta PubMedistä, mutta sama logiikka toimii kaikissa tietokannoissa
    • Hakulauseella “pulmonary tuberculosis” AND (treatment OR therapy) saa täsmällisemmän tuloksen kuin haulla tuberculosis treatment
  • MeSH-termit
    • Videossa haetaan influenssarokotteiden mahdollisia haittavaikutuksia kananmuna-allergikoille
    • edellisestä aiheesta hakulause MeSH-termein voisi olla “Tuberculosis, Pulmonary/therapy”[Mesh]
  • Rajaukset
    • PubMedin vasemman reunan rajausmahdollisuuksista osa on piilossa (klikkaa more) ja muutenkin rajausten tekeminen on monivaiheista
    • Kannattaa silti käyttää tilanteen mukaan esimerkiksi julkaisutyyppi-, julkaisuaika-, julkaisukieli- ja ikäryhmärajauksia
    • Video
    • Vältä rajausta Free full text. Se jättää hakutuloksesta pois kirjaston hankkimat ja maksamat lehdet.

 

On June 16, 2015, the 25 millionth journal citation was added to PubMed. Searching with one or two words retrieves such a huge amount of citations that it takes a long time to find the ones that answer your question. How to make the search result more accurate but also more comprehensive?

With these tools

  • Planning the search
    • The concepts that describe the topic and the terms for them
  • Boolean logic
    • Same logic of combing search terms in all databases
    • Using “pulmonary tuberculosis” AND (treatment OR therapy) gives a more accurate set of results than tuberculosis treatment
  • MeSH terms
    • Video shows how to search if there are concerns with flu vaccines and egg allergy
    • About the topic above the search using MeSH could be “Tuberculosis, Pulmonary/therapy”[Mesh]
  • Limits
    • Some of the Limit options in PubMed are hidden (click more to see them) and using the limits is sometimes complicated
    • Try anyway, depending on your topic, for example article types, publication dates, languages, and ages
    • Video
    • Avoid using the limit Free full text. It omits the journals the library has subscribed and paid for.

 

Tuulevi Ovaska
palvelupäällikkö, tietoasiantuntija
head of services, information specialist